Forensic Genomics

ForenSeq mtDNA Control Region Kit

특징

• 100pg gDNA 이용 
• 심하게 손상된 샘플에 대한 탁월한 분해능
• 멀티플렉싱 기능으로 운영효율 향상 – 최대 48개의 샘플을 풀링하고 시퀀싱
• 최대 변이 검출을 위한 짧은 평균 앰플리콘 크기
• PCR 억제제에 최적화된 버퍼 
• 최적의 실험실 효율성을 위한 통합 워크플로우

미토콘드리아 DNA는 핵 DNA가 손상되거나 없을 때 강력한 대체 정보 소스입니다. 뿌리 없는 머리카락, 치아, 뼈 및 기타 까다로운 소스에 사용되는 mtDNA는 실종자 및 재해 피해자 신원 확인에 주로 사용되고 있습니다. 

ForenSeq mtDNA Control Region 키트는 최소한의 input DNA와 최적의 감도로 미토콘드리아 게놈(mtGenome)의 제어 영역을 조사하기 위해 편리하고 효율적으로 라이브러리를 준비할 수 있습니다. 그리고 CODIS에 직접 업로드할 수 있도록 전체 제어 영역에서 간결한 데이터 세트를 생성합니다. 멀티플렉싱 기능은 비용이나 시간의 증가 없이 운영 효율성을 높입니다.

mtDNA 제어 영역의 상대적으로 높은 돌연변이률과 오래되고 분해된 시료를 분석 대상으로 하는 법의학 샘플의 특성으로 인해 최적의 프라이머 설계가 어렵습니다. 심하게 분해된 시료에서 성능을 개선하기 위해 ForenSeq mtDNA Control Region 키트는 최근 정리된 mtDNA 변이 및 빈도 데이터에서 설계된 120개 이상의 프라이머를 사용하여 mtDNA 제어 영역에서 18개의 기본 앰플리콘을 생성합니다. 모든 1차 앰플리콘의 길이는 150bp 미만이고 대부분은 100bp 미만입니다. 이는 현재 상업용 mtDNA 분석 시스템 중 가장 작은 평균 앰플리콘 크기입니다. 타일식 접근 방식은 품질이 저하된 샘플에서 데이터 손실로 이어질 수 있는 시퀀스 간격을 방지하기 위해 앰플리콘을 중첩합니다. 그리고 버퍼 시스템은 칼슘, 부식산 및 기타 관련 PCR 억제제에서도 사용할 수 있도록 최적화 되어 있습니다. 

mtDNA Control Region Kit 규격

Feature Details
 Target size 1200 bp mtDNA control region
 DNA input recommendation 100 pg gDNA and mtDNA per sample
 Sample types DNA extracted from a range of degraded samples, including bone, teeth and hair shaft
 Recommended multiplexing capacity 3–48 libraries per run
 Number of primers >120
 Number of amplicons 18
 Average amplicon size 118 bp
 Amplicon overlap ≥ 3 bp
 Total library prep time 7 hours and 45 minutes
 Hands-on time 1 hour and 30 minutes