Forensic Genomics
ForenSeq MainstAY Prep Kit
Autosomal과 Y-STRs를 타겟으로 하는 키트로 개인식별에 사용
특징
• 27개의 Au-STRs과 25개의 Y-STRs 마커
• European/SWGDAM 최소 Y-haplotype, CODIS, Interpol 및 ESS(European Standard Set) 요구 사항 충족
• 1ng input gDNA로 재현성있고 높은 call rate 결과 획득
• 한 번에 96개 샘플 동시 시퀀싱
• 사례연구를 위해 NDIS (National DNA Index System)에 업로드하도록 승인된 키트
• 전세계 기존 데이터베이스와의 호환성 유지
• 1.5일 이내에 보고서 생성
MainstAY 제품은 일반적인 개인 식별 애플리케이션에 사용되는 확립된 STR에 초점을 맞추고 글로벌 데이터베이스와의 호환성을 유지함으로써 NGS로의 전환을 쉽게 해줍니다. 친숙하고 입증된 ForenSeq 워크플로는 2시간 미만의 핸즈온 타임으로 최대 96개의 증거 샘플에 대한 DNA 프로필을 생성합니다.
ForenSeq MainstAY 키트에서 27개의 상염색체 및 25개의 Y-STR 유전자 좌위를 작은 앰플리콘으로 증폭하고 MiSeq FGx Reagent Micro Kit를 사용하여 MiSeq FGx 시퀀싱 시스템에서 시퀀싱 데이터를 생성하는 시약이 포함되어 있습니다. 이 워크플로를 사용하면 Au-STRs와 Y-STRs의 서열과 대립유전자 길이 다형성을 단일 증폭으로 구별할 수 있습니다. 이를 통해 여러 가지 워크플로를 실행할 필요가 없어지고 법의학 샘플의 정보 가치가 최대화 되어 통계적 포함 능력이 향상됩니다. 또한 NGS는 대립 유전자가 겹치는 문제를 제거하여 사용자가 멀티플렉스에서 더 많은 대립 유전자를 조사할 수 있도록 합니다.
• Markers in the ForenSeq MainstAY Kit
| Autosomal STRs | Y-STRs |
| D1S1656 vWA CSF1PO SE33* D20S482 | DYF387S1 DYS43 DYS393 DYS570 |
| TPOX D12S391 D6S1043 D21S11 | DYS19 DYS448 DYS437 DYS576 |
| D2S441 D13S317 D7S820 PentaD | DYS385a-b DYS460 DYS438 DYS612 |
| D2S1338 PentaE D8S1179 D22S1045 | DYS389I DYS481 DYS635 Y-GATA-H4 |
| D3S1358 D16S539 D9S1122 TH01 | DYS389II DYS505 DYS643 |
| D4S2408 D17S1301 | DYS390 DYS522 |
| FGA D18S51 | DYS391 DYS533 |
| D5S818 D19S433 D10S1248 | DYS392 DYS549 |
| Amelogenin |
기존 CE 분석과 비슷한 비용으로 단일 증폭 및 시퀀싱 실행을 통해 핵심 CODIS 및 ESS (유럽표준세트) STR 유전자좌에 대한 매우 식별력있는 데이트를 얻을 수 있습니다.
ForenSeq MainstAY Kit 규격
| Feature | Details |
| DNA input recommendation | 1 ng per sample from gDNA, buccal swabs, FTA card; 1.2 mm per sample from FTA card punch |
| Kit configuration | 96 reaction kit and 384 reaction kit |
| Recommended multiplexing capacity | 8–96 samples per run |
| Locus multiplexing capacity | Simultaneous analysis of 52 genetic markers |
| Primer mix content | 27 global autosomal STRs including CODIS and European Standard set; 25 Y-STRs including minimum set for the Y Haplotype Reference Database (YHRD) |
| Amplicon size | Mean: 235 bp; Maximum: 481 bp |
| Low level mixture detection | Detects minor contributors at 5% |
| Total prep time | Library: 7 hours and 15 minutes; Hands-on: 1 hour and 30 minutes |
| Total sequencing time | About 28 hours with the MiSeq FGx Reagent Kit; about 22 hours with the MiSeq FGx Reagent Micro Kit |