Affinity Screening
스크리닝
Dianthus
Dianthus는 384 plate를 이용하고 microfluidics-free 플랫폼의 결합력 스크리닝 장비입니다.
용액내에서 크기에 상관없이 결합력을 측정할 수 있으므로 분자간의 상호작용 스크리닝에 매우 적합합니다.
| Dianthus는 플레이트 기반의 microfluidics-free 플랫폼의 결합력 스크리닝 장비입니다. |
• pM ~ mM까지 넓은 범위의 결합력 측정 가능
• Immobilization Free
• 적은 양의 샘플 소모 (각 분자당 10µL 필요)
• 애플리케이션 : PROTAC, 프래그먼트 라이브러리 그리고 IDPs (intrinsically disordered proteins) 측정 가능
• Maintenance free
• 초기활성물질과 선도물질 확인 및 최적화에 사용 가능
• Spectral Shift와 TRIC이라는 두 가지 기술이 적용되어 민감성이 향상되었으며, 특히 Spectral Shift를 이용하면 90초안에 Kd 값을 측정하여 시간 절약
Dianthus Software
분석 소프트웨어는 스크리닝 결과 요약 뿐만 아니라 랭킹테이블 및 히스토그램을 제공합니다.
Dianthus 기술 소개
1. Spectral Shift (Monolith X에만 적용) : 분자들간의 상호작용이 일어나면 형광 스펙트럼이 blue shift나 red shift 쪽으로 이동합니다. 이 변화를 650nm와 670nm ratio를 결합 파트너의 농도에 대한 그래프로 플로팅하여 dissociation constant 또는 Kd 값을 계산합니다. 샘플을 섞는 동시에 반응이 일어나므로 짧은 시간안에 측정이 가능하며, MST 기술과 비교했을 때 응집(aggregation)이나 균질화에 영향을 덜 받습니다.
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2. Temperature Related Intensity Change (TRIC) : 형광으로 표지된 타겟과 리간드를 섞은 후 레이저를 이용하여 온도 변화를 일으키면 상호작용이 일어난 분자들은 형광 강도가 변합니다. 이 변화를 결합 파트너(Ligand) 농도에 대한 그래프로 플로팅하여 dissociation constant 또는 Kd 값을 계산합니다.
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Dianthus 스펙
| Dianthus | ||
|---|---|---|
| Biophysical modalities | Spectral Shift and TRIC | |
| Format | 384-well plate (barcoded and sealable) | |
| Affinity range | pM to mM | |
| Data points per run | Up to 384 | |
| Run time for 384 data points | 33 minutes (Spectral Shift) 79 minutes (Spectral Shift + TRIC) | |
| Time it takes to get a Kd 12-point dilution series | 60 seconds (Spectral Shift) 132 sec (Spectral Shift + TRIC) | |
| Sample volume/well | 20 µL | |
| Molecular weight range | 101-107 Da | |
| Temperature control | 20-25 °C +/- 0.5 °C (actively controlled) | |
| Dimensions | 61 cm W x 42 cm H x 57 cm D | |
| Weight | 70 kg | |
| Compounds tested in 24 h (single dose, in duplicate, plate feeder) | 7,400 | |
| Kds measured in 24 h (12-point dilution series, plate feeder) | 1,350 | |