Forensic Genomics
ForenSeq Kintelligence Prep Kit
먼 친척관계 및 유전적 계보 연구를 위한 키
특징
• 선별된 10,230개의 SNP 마커를 이용해 먼 친족관계까지 확인
• 법의학 관련 SNP의 효율적인 평가를 위한 간소화된 워크플로우
• 법의학적으로 선별된 마커 – 의료 데이터 개인 정보 보호 문제를 최소화
• 단일 SNP 멀티플렉스- 전 세계 인구에 걸쳐 작용
• ForenSeq 및 GEDmatch 워크플로우가 완전히 통합되어 하나의 시스템처럼 작동하며 해당 워크플로우를 사용할 때 필요한 기술 지원
미해결 사건 샘플과 실종자 샘플은 노령, 환경 요소 및 오염 물질에 대한 노출, 다양한 추출 및 보관 절차로 인해 품질이 저하되는 경우가 많습니다. Verogen은 손상된 샘플에서 높은 복구율을 제공하도록 ForenSeq Kintelligence 키트를 설계했으며, 품질이 저하되고 억제된 케이스워크 유형 샘플을 분석하는 연구를 수행하고, 대조 샘플로 민감도 평가를 수행하여 키트가 다양한 input DNA 양에 걸쳐 SNP calls을 재현성 있게 생성하도록 만들었습니다. 최적화된 버퍼 시스템은 법의학 샘플에서 일반적으로 발견되는 칼슘, 인디고, 부식산 등 다양한 억제제를 허용하며 98% 이상의 call rate를 생성합니다. 즉, ForenSeq Kintelligence kit는 어려운 환경에서도 효과적으로 작동하고 신뢰할 수 있는 결과를 제공할 수 있도록 설계되어 가장 까다로운 법의학 샘플의 분석도 신뢰할 수 있습니다.
• ForenSeq Kintelligence Kit 규격
| Feature | Details |
| Sample type | gDNA from hair, bone, teeth, blood, semen and buccal swabs |
| DNA input recommendation | 1 ng per sample |
| Kit configuration | 12 reactions |
| Recommended multiplexing capacity | 3 libraries per run |
| Number of SNPs | 10,230 |
| Mean amplicon size | < 150 bp |
| Total library prep time | 8 hours |
| Hands-on library prep time | 1 hour and 55 minutes |
| Total sequencing time | 28 hours |
강력한 중합효소 연쇄 반응(PCR) 및 프라이머 설계로 단일 SNP 멀티플렉스가 가능하므로 테스트를 여러 번 할 필요가 없습니다. 150bp 미만의 작은 평균 앰플리콘 크기는 증폭 효율을 향상시키고 분해된 DNA의 복구 및 분석을 용이하게 합니다. 또한 ForenSeq Kintelligence 키트에는 최적의 데이터 복구를 위해 6개의 고유 이중 인덱스(Unique Dual Index, UDI) 어댑터가 포함되어 있습니다.
ForenSeq Kintelligence Prep Kit markers
| Ancestry SNPs | 56 | 0.5% |
| Identity SNPs | 94 | 1% |
| Kinship SNPs | 9867 | 96% |
| Phenotype SNPs* | 22 | 0.2% |
| X-SNPs | 106 | 1.2% |
| Y-SNPs | 85 | 0.9% |
ForenSeq Kintelligence의 디자인은 ForenSeq DNA Signature Prep에 영향을 받아, 수사 과정에서 조사자들에게 유용한 정보나 힌트를 제공할 수 있도록 검증된 모든 생물 지리학적 조상, 정체성 및 형질 SNP를 포함하도록 구성되었습니다. 또한 가계 및 생물학적 성별 확인을 돕기 위해 Y-SNP 및 X-SNP도 포함되어 있습니다.
FGG 방법 비교
-Microarray, WGS and Targetd Sequencing-
FGG는 Microarray 유전분석 또는 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 방법을 사용하여 DNA 프로필을 생성하고 GEDmatch와 같은 가계도 데이터베이스에서 유전적으로 관련된 개인을 비교하는 것을 결합한 것입니다. GEDmatch는 범죄 조사를 위해 자발적으로 제출된 DNA 프로필의 최대 데이터베이스로, 데이터베이스 내에서 비교를 통해 가계도를 작성하고 인구 조사 기록, 인적 기록, 부고 및 신문 아카이브를 사용하여 DNA의 출처를 추적할 수 있게 합니다.
Microarray 및 WGS 기반 방법은 법의학 사례와 관련된 다양한 생물학적 샘플의 적용에 한계가 있습니다. 이러한 샘플들은 주로 원료 물질의 노후화나 환경 노출로 인해 손상되거나 억제되어 FGG를 제한하는 낮은 품질의 데이터를 초래합니다. 또한 의료 관련 SNP 데이터의 대량 생성으로, 법의학 적용에 필요하지 않은 많은 양의 데이터를 생산하게 되어 유전 데이터 개인정보 및 사용에 대한 우려를 불러일으킵니다. ForenSeq Kintelligence Kit는 법의학 목적에 적합한 유일한 FGG 어세이입니다. National DNA Index System (NDIS)에서 승인한 MiSeq FGx Sequencing System에서 시퀀을 위해 설계되었으며, Universal Analysis Software (UAS)에서 데이터 분석을 진행하고 GEDmatch PRO에서의 먼 친척 관계 분석과 함께, ForenSeq Kintelligence 및 Verogen STR 어세이를 사용하면 DNA 정보를 통해 기인의 신원을 확인하는데 도움을 줄 수 있습니다.